تشرف بلدية بيت لحم على إدارة المدينة، وتعد من أقدم البلديات في فلسطين. تأسست بلدية بيت لحم عام 1872، تمتلك البلدية مقراً دائماً لها مقابل كنيسة المهد في ساحة المهد، وتقدم البلدية العديد من الخدمات للمواطنين، ولحرصها على تسهيل معاملات المواطنين وتيسير تقديم الخدمات لهم، عملت بلدية بيت لحم عام 2014 على إنشاء مركز لخدمات الجمهور. كما أنها تقوم بتنفيذ مشاريع كثيرة في المدينة، كما قامت بتوقيع 90 اتفاقية توأمة مع العديد من مدن في العالم وخاصة المدن الأوروبية مثل مدن إيطاليا، فرنسا وغيرها.
عام 1872، تولى رئاسة أول مجلس بلدي ميخائيل أبو سعادة. وبعد انتخابات عام 1976 والتي فاز بها رئيس البلدية حينها المرحوم الياس فريج لم تجرى انتخابات لمدة 25 سنة. عند دخول السلطة الوطنية الفلسطينية عينت وزارة الحكم المحلي مجلساً جديداً مكوناً من 15 عضواً برئاسة حنا ناصر، الذي كان نائباً لرئيس البلدية منذ عام 1976. في أيار من العام 2005 تم إجراء انتخابات بلدية وانتخب مجلس جديد مكون من 15 عضوا برئاسة د. فكتور بطارسة.
وفي عام 2012، تم انتخاب أ. فيرا بابون كأول امرأة ترأس مجلس بلدية بيت لحم، بالإضافة إلى 14 عضوا من أبناء مدينة بيت لحم.
وفي العام 2017، تم إنتخاب المحامي أنطون سلمان كرئيس للبلدية، بالإضافة إلى 14 عضوا.
وفي العام 2022، تم إنتخاب الأستاذ حنا حنانيا كرئيس للبلدية، بالإضافة إلى 14 عضوا.